banner
Lar / blog / As amilases bacterianas permitem a degradação do glicogênio pelo microbioma vaginal
blog

As amilases bacterianas permitem a degradação do glicogênio pelo microbioma vaginal

Nov 22, 2023Nov 22, 2023

Nature Microbiology volume 8, páginas 1641–1652 (2023)Cite este artigo

4270 Acessos

70 Altmétrico

Detalhes das métricas

A microbiota vaginal humana é frequentemente dominada por lactobacilos e a transição para uma comunidade mais diversificada de micróbios anaeróbicos está associada a riscos para a saúde. Acredita-se que o glicogênio liberado pelas células epiteliais lisadas seja uma importante fonte de nutrientes na vagina. No entanto, o mecanismo pelo qual as bactérias vaginais metabolizam o glicogênio não é claro, com evidências implicando enzimas bacterianas e humanas. Aqui caracterizamos bioquimicamente seis enzimas degradadoras de glicogênio (GDEs), todas elas pullanases (homólogos de PulA), de bactérias vaginais que suportam o crescimento de Lactobacillus crispatus deficiente em amilase em glicogênio. Revelamos variações na tolerância ao pH, preferências de substrato, produtos de degradação e suscetibilidade à inibição. A análise dos conjuntos de dados do microbioma vaginal mostra que estas enzimas são expressas em todos os tipos de estados comunitários. Finalmente, confirmamos a presença e atividade de GDEs bacterianos e humanos no líquido cervicovaginal. Este trabalho estabelece que os GDEs bacterianos podem participar na degradação do glicogénio, fornecendo informações sobre o metabolismo que pode moldar a microbiota vaginal.

A disbiose na microbiota vaginal humana está associada a resultados adversos para a saúde1. A composição da comunidade bacteriana pode ser classificada taxonomicamente em um dos cinco tipos de estado de comunidade (CSTs)2. CST I – III e V são dominados por uma única espécie de Lactobacillus: L. crispatus, L. gasseri, L. iners e L. jensenii, respectivamente. Por outro lado, o CST IV consiste em um grupo diversificado de micróbios anaeróbicos e anaeróbicos facultativos, incluindo espécies de Gardnerella, Prevotella, Mobiluncus e baixos níveis de Lactobacillus. As TSC dominadas por Lactobacillus estão associadas a um pH vaginal abaixo de 4,5, baixos escores de Nugent e inflamação reduzida3, enquanto a TSC IV está associada a um pH mais elevado e a diversas sequelas de saúde, incluindo aquisição de HIV4, vaginose bacteriana5 e parto prematuro6. No entanto, é importante notar que o CST IV está sobrerrepresentado em mulheres hispânicas e negras saudáveis ​​e não é necessariamente indicativo de disbiose7. No geral, tornou-se claro que a composição da microbiota vaginal por si só é insuficiente para prever os resultados de saúde e que obter uma compreensão mecanicista desta comunidade requer decifrar as funções bacterianas vaginais1.

Uma função conhecida por influenciar a composição e a estabilidade das comunidades bacterianas associadas ao hospedeiro é a liberação de carboidratos de fontes dietéticas ou derivadas do hospedeiro pelas hidrolases glicosídicas. Embora isto esteja bem estabelecido na microbiota intestinal humana8,9,10,11, o metabolismo dos carboidratos no ambiente vaginal é pouco compreendido. Acredita-se amplamente que o glicogênio liberado pelas células epiteliais esfoliadas e lisadas apoia a colonização de lactobacilos vaginais12,13, uma vez que os níveis de glicogênio em amostras vaginais estão associados à dominância de Lactobacillus e ao baixo pH vaginal14. No entanto, até recentemente, as tentativas de obter isolados vaginais de Lactobacillus capazes de crescer em glicogênio foram em grande parte malsucedidas, levantando a questão de saber se e como as bactérias vaginais acessam essa fonte de carbono.

O glicogênio consiste em cadeias lineares de unidades de glicose ligadas a α-1,4-glicosídicas, com ramificações α-1,6-glicosídicas periódicas. O metabolismo do glicogênio requer hidrolases glicosídicas extracelulares para liberar polímeros de glicose mais curtos (maltodextrinas). Vários lactobacilos vaginais utilizam maltodextrinas para crescimento, levando a uma hipótese inicial de que uma glicosídeo hidrolase não-Lactobacillus no ambiente vaginal libera esses oligossacarídeos17. A detecção de α-amilase humana em amostras de lavado cervicovaginal (CVLs) pode apoiar esta proposta17,18. Mas ainda não foi estabelecido como a amilase humana, que é produzida predominantemente no pâncreas e nas glândulas salivares17, é encontrada no fluido genital.

20% of CST III metagenomes. However, the detection of these genes in the metatranscriptomes was highly variable (6.45%–38.7%)./p>0 genes per bacterial genome. A multiple comparisons (Dunnett) one-way ANOVA was performed to determine statistically significant differences compared to CST I abundance (CST IV, ****P < 0.0001; CST V, *P = 0.0196; NSP > 0.05,) The box represents 1.5× the interquartile range and the whiskers represent the minimum to the maximum of the dataset. The centerline denotes the median. b, Heat map of metagenomic presence and abundance detected using ShortBRED within each sample. NP, not present. c, ABPP analysis identifies bacterial GDEs and human proteins (α-amylase and GAA) in CVF supernatants. ND, not detected; GAA, lysosomal α-glucosidase. d, Human CVF contains distinctly bacterial pullulanase activity at pH 5.5. Data are representative of three experimental replicates over 2 d and the error bars are one standard deviation above and below the mean. A multiple comparisons (Dunnett) one-way ANOVA was performed to determine statistically significant differences compared to the no-CVF sample (blue) (S003, ****P < 0.0001; S011, ****P < 0.0001)./p>35% amino acid identity from microbes associated with health or disease were selected. Genomic DNA was extracted from the encoding strains with a DNeasy UltraClean microbial kit (Qiagen). Genes were amplified via PCR removing the signal peptide (Supplementary Fig. 1) and cloned into the E. coli expression vector pET28a (Novagen) via Gibson assembly to generate an N-terminal His6-tagged gene. Plasmids were then transformed into the expression host BL21 (DE3) (P. bivia enzymes) or ArcticExpress (DE3) (all other enzymes) for expression and purification. Complete lists of plasmids and primers are provided in Supplementary Table 2 and Supplementary File 1, respectively./p>0) by the total number of samples with the corresponding CST./p>0.95 (corresponding to ~2% FDR) were searched for CAZyme domains using dbCAN 2 (ref. 68)./p>

0). The sample size is as follows: CST I, n = 39; CST II, n = 16; CST III, n = 31; CST IV, n = 83; CST V, n = 9./p>